Graphpad Prism棱鏡科研繪圖工具基本簡介

      Graphpad Prism 是一款優(yōu)秀的統(tǒng)計(jì)繪圖軟件，集生物統(tǒng)計(jì)、曲線擬合、科研繪圖于一體。軟件專門為科研工作者設(shè)計(jì)，可以輕松地進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析并繪制統(tǒng)計(jì)圖，已被世界知名學(xué)府、科研機(jī)構(gòu)、醫(yī)學(xué)中心和制藥企業(yè)廣泛使用。Graphpad Prism 具有功能實(shí)用、操作便捷等特點(diǎn)，自推出以來受到了很多用戶的喜愛，該軟件集生物統(tǒng)計(jì)、曲線擬合和科學(xué)繪圖于一體，可以幫助醫(yī)學(xué)人員輕輕松松就可以制作出專業(yè)的醫(yī)學(xué)表。

Graphpad Prism棱鏡科研繪圖工具軟件科普

      非線性回歸是分析數(shù)據(jù)的重要工具，但往往比需要的難度更大。 沒有其他程序能像 Prism 那樣簡化曲線擬合。 事實(shí)上，你通常可以在一個(gè)步驟中適合曲線。 只需從常用方程式的廣泛列表中選擇一個(gè)方程式(或輸入您自己的方程式)，Prism 會自動(dòng)完成其余部分 – 適合曲線，以表格形式顯示結(jié)果，在曲線圖上繪制曲線，并插入未知值。將多個(gè)數(shù)據(jù)集的數(shù)據(jù)并排放置在有組織的數(shù)據(jù)表上，而 Prism 可以一次將所有的數(shù)據(jù)集合在一起。 您可以分別將相同的模型擬合到每個(gè)數(shù)據(jù)集，使用全局非線性回歸在數(shù)據(jù)集之間共享參數(shù)值，或?qū)⒉煌哪Ｐ蛿M合到不同的數(shù)據(jù)集。

      麻雀雖小五臟俱全，Prism 也為您提供了許多先進(jìn)的配件選擇。它可以將最佳擬合參數(shù)的置信區(qū)間報(bào)告為非對稱范圍(P值相似方法)，它比通常的對稱區(qū)間要精確得多。 它還可以自動(dòng)插入標(biāo)準(zhǔn)曲線中的未知值(即分析RIA數(shù)據(jù))，使用F檢驗(yàn)或Akaike信息準(zhǔn)則(AIC)比較兩個(gè)方程的擬合，繪制殘差，識別異常值，差異重量數(shù)據(jù)點(diǎn)，測試正常性的殘差等等。

Graphpad Prism棱鏡科研繪圖工具軟件功能

      科技繪圖

      1. 操作簡單快捷：

      1.1 輸入數(shù)據(jù)后，軟件自動(dòng)生成統(tǒng)計(jì)圖，無需專門繪制。

      1.2 工具欄按鈕簡潔明了，一鍵式操作，包含了所有的繪圖和分析功能。

      2. 圖片類型齊全：

      2.1 能繪制各種類型的統(tǒng)計(jì)圖。

      2.2 可以自定義圖片的各個(gè)細(xì)節(jié)，得到漂亮的統(tǒng)計(jì)圖。

      2.3 滿足科研數(shù)據(jù)繪圖的所有要求，包括誤差條、對數(shù)軸、不連續(xù)參數(shù)軸、希臘字符等。

      3. 高質(zhì)量的圖片輸出：

      3.1 支持多種格式的圖片輸出，包括高分辨率的TIF格式和EPS格式，滿足發(fā)表文章的各種需要。

      3.2 運(yùn)用Layout工具，將多個(gè)相關(guān)的統(tǒng)計(jì)圖排版到同一個(gè)頁面中

      生物統(tǒng)計(jì)

      1. 統(tǒng)計(jì)分析功能更加實(shí)用和精煉，能輕松地利用軟件進(jìn)行實(shí)驗(yàn)室和臨床研究所需要的統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)，包括：T檢驗(yàn)、nonparametric comparisons、單/雙因素方差分析、線性回歸、非線性回歸、列聯(lián)表分析、生存分析。

      2. 提供完善的統(tǒng)計(jì)分析幫助系統(tǒng)，點(diǎn)擊統(tǒng)計(jì)分析對話框中的“Learn”按鈕，打開對應(yīng)的幫助資源，幫您選擇正確的統(tǒng)計(jì)方法。

      曲線擬合

      1. 非線性回歸方程齊全，具有強(qiáng)大的非線性回歸分析功能。

      2.分析過程簡單，根據(jù)數(shù)據(jù)選擇正確的回歸方程后，軟件自動(dòng)進(jìn)行曲線擬合并生成結(jié)果表格以及繪制曲線圖。

      3.能根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)曲線自動(dòng)計(jì)算樣本結(jié)果。

      4. 能運(yùn)用F檢驗(yàn)或者Akaike’s Information Criterion對兩個(gè)擬合方程進(jìn)行比較

Graphpad Prism棱鏡科研繪圖工具特色功能

      1. 自動(dòng)生成誤差條：輸入重復(fù)樣本的數(shù)據(jù)后，軟件自動(dòng)計(jì)算并在統(tǒng)計(jì)圖上生成誤差條，而不需要人為操作。

      2. 同時(shí)分析多個(gè)相關(guān)實(shí)驗(yàn)的數(shù)據(jù)。

      3. 分析重復(fù)實(shí)驗(yàn)的效率高：任何一次分析都可以作為其重復(fù)實(shí)驗(yàn)的模板，導(dǎo)入重復(fù)實(shí)驗(yàn)的數(shù)據(jù)后。

      4.軟件自動(dòng)進(jìn)行數(shù)據(jù)分析并作圖。

      5. 修正輸入的數(shù)據(jù)，軟件能自動(dòng)對其分析結(jié)果和統(tǒng)計(jì)圖進(jìn)行同步修正。

Graphpad Prism棱鏡科研繪圖工具安裝步驟

      1、在華軍軟件園下載這款軟件的壓縮包，解壓后，雙擊exe文件，進(jìn)入安裝界面，點(diǎn)擊browse可以修改默認(rèn)在C盤的安裝位置，建議大家選擇安裝在D盤，然后點(diǎn)擊install

      2、軟件正在安裝，我們耐心等待

      3、軟件安裝成功，點(diǎn)擊finish即可

Graphpad Prism棱鏡科研繪圖工具使用方法

      1、數(shù)據(jù)的錄入

      打開GraphPad Prism軟件后，軟件會讓操作者選擇數(shù)據(jù)的輸入類型，此時(shí)注意選擇“Column”這個(gè)選項(xiàng)。如圖2所示：

      之后分別輸入兩組變量的值。如圖3所示，實(shí)驗(yàn)組共5個(gè)樣本，檢測數(shù)值分別為1，2，3，4和5;對照組也是5個(gè)樣本，分別是4，5，6，7和8。也可以在表頭上對數(shù)據(jù)進(jìn)行標(biāo)識，分別為Experiments和Controls。如果此處不進(jìn)行標(biāo)識，默認(rèn)的組名是Dataset A和Dataset B。

      2、結(jié)果的運(yùn)算

      結(jié)果錄入完畢后，點(diǎn)擊菜單欄中的Analyze，會出現(xiàn)如圖4所示的界面。注意左側(cè)一定要選中”t tests (and nonparametric tests)”。

      點(diǎn)擊圖4中的OK，會進(jìn)入如圖5所示界面。在此界面中，軟件要求作者選擇是否配對(Paired和Unpaired)，并決定選擇參數(shù)檢驗(yàn)還是非參數(shù)檢驗(yàn)。所謂參數(shù)檢驗(yàn)就是指配對t檢驗(yàn)或獨(dú)立樣本t檢驗(yàn)，而非參數(shù)檢驗(yàn)則是指Mann-Whitney U檢驗(yàn)或配對Wilcoxon檢驗(yàn)。如果選擇參數(shù)檢驗(yàn)(默認(rèn)兩組數(shù)據(jù)均呈正態(tài)分布)，軟件會讓操作者選擇方差是否齊。

      如果方差齊，軟件會選擇t檢驗(yàn)，如果不齊，軟件推薦Welch法。需要說明的一點(diǎn)是，如果兩組數(shù)據(jù)均呈正太分布，但方差不齊，此時(shí)應(yīng)采用校正t檢驗(yàn)，目前有三種主要的校正t檢驗(yàn)法：Cochran & Cox法、Satterthwait法和Welch法。GraphPad Prism僅支持Welch法。

      如果兩組數(shù)據(jù)不呈正太分布，則應(yīng)該選用非參數(shù)檢驗(yàn)。非參數(shù)的兩個(gè)選項(xiàng)分別是Mann-Whitney U檢驗(yàn)和Kolmogorov-Smirnov檢驗(yàn)。一般選擇Mann-Whitney U檢驗(yàn)。

      除了Experimental Design以外，還可以對Optional選項(xiàng)里面的內(nèi)容進(jìn)行修改。如圖6所示。一般建議選擇“Discreptive statistics for each data set”(展示各組數(shù)據(jù)的均數(shù)、中位數(shù)、標(biāo)準(zhǔn)差、秩和等)選項(xiàng)。在P value一段，系統(tǒng)默認(rèn)為雙尾檢驗(yàn)，一般建議不要更改。

      所有的選項(xiàng)選擇完畢后，點(diǎn)擊OK即可進(jìn)行計(jì)算。

      3、結(jié)果的解讀

      結(jié)果一般分為兩個(gè)部分，一是差異是否具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義;二是差異有多大。如果研究者選擇了Mann-Whitney U檢驗(yàn)，則可得到如圖7所示的結(jié)果。

      參數(shù)分析結(jié)果的解讀與此類似，只不過多了個(gè)F test to compare variances，即方差是否齊。一般認(rèn)為，P值大于0.10才可以認(rèn)為兩組數(shù)據(jù)方差相同(注意：是“大于”，不是“小于”!是“0.10”，不是“0.05”!!!!)。

      4、檢驗(yàn)數(shù)據(jù)是否呈正態(tài)分布

      可能有的讀者會問GraphPad Prism能否判斷數(shù)據(jù)是否呈正態(tài)分布。其實(shí)是可以進(jìn)行正態(tài)分布檢驗(yàn)的。以上述兩組數(shù)據(jù)為例，首先點(diǎn)擊Analyze，然后選擇XY Analysis下面的Column statistics。如圖8所示：

      如圖9所示，GraphPad Prism提供了三種檢驗(yàn)數(shù)據(jù)是否呈正態(tài)分布的方法：D’Agootino-Pearson法，Kolmogorov-Smirnov法和Shapiro-Wilk法。針對同一種數(shù)據(jù)，三種方法的計(jì)算結(jié)果大同小異。雖然GraphPad Prism不推薦用Kolmogorov-Smirnov法，但根據(jù)筆者經(jīng)驗(yàn)，在國際上發(fā)表論文時(shí)，多采用Kolmogorov-Smirnov法的結(jié)果，可能是因?yàn)楫?dāng)樣本量太小時(shí)，Shapiro-Wilk法和D’Agootino-Pearson法無法給出檢驗(yàn)結(jié)果。當(dāng)然，也可以三種方法都選擇，綜合判斷數(shù)據(jù)是否呈正態(tài)分布。

      選擇好統(tǒng)計(jì)方法之后點(diǎn)擊OK，就可以得到正態(tài)檢驗(yàn)的結(jié)果，如圖10所示。需要特別說明的是：在正態(tài)檢驗(yàn)中，一般認(rèn)為P大于0.10才表述數(shù)據(jù)呈正態(tài)分布(注意：是“大于”，不是“小于”!是0.10，不是“0.05”!!!!)。在本案例中，兩組數(shù)據(jù)的P值均為0.20，因此可以認(rèn)為兩組數(shù)據(jù)均呈正態(tài)分布。

Graphpad Prism棱鏡科研繪圖工具常見問題

      用Graphpad Prism棱鏡科研繪圖工具官方版軟件繪制散點(diǎn)圖及線性分析?

      打開Graphpad Prism棱鏡科研繪圖工具官方版，將Y右側(cè)的第一欄選中，點(diǎn)擊create。

      分別在X和Group A下方對應(yīng)的空白處輸入組別，并在X、Y下方輸入數(shù)據(jù)。

      點(diǎn)擊Graphs下方的Data1，輸出圖片，選擇散點(diǎn)圖，點(diǎn)擊ok。

      點(diǎn)擊Analyze，點(diǎn)擊線性回歸(Linear regression)。

      點(diǎn)擊ok，彈出如下對話框，繼續(xù)點(diǎn)擊Ok，出現(xiàn)擬合好的直線圖。

      繼續(xù)點(diǎn)擊analyze，開始進(jìn)行相關(guān)性分析。將線性回歸改成相關(guān)性(correlation)。

      點(diǎn)擊Ok，彈出如下對話框，繼續(xù)點(diǎn)擊ok。在結(jié)果中可以看到散點(diǎn)圖的Pearson r 相關(guān)性以及P value大小。

同類軟件對比

      CorelDraw2020官方版是一款由Corel公司精心打造的全新型矢量圖形制作軟件，cdr2020便捷實(shí)用，可以讓您更加輕松地進(jìn)行矢量插圖、頁面布局、圖片編輯和設(shè)計(jì)等圖像處理操作，CorelDraw2020軟件功能強(qiáng)悍，能夠給用戶帶來全新的LiveSketch矢量圖繪制體驗(yàn)。

      Photoshop2020官方版是一款出自Adobe公司之手的全新圖形處理軟件，ps2020軟件功能強(qiáng)勁，能夠完美滿足業(yè)余攝影師、攝影愛好者和商務(wù)用戶等的設(shè)計(jì)需求，并且Photoshop2020官方版操作簡單，用戶不用掌握太多的專業(yè)知識即可輕松地對照片進(jìn)行修飾加工處理。

Graphpad Prism棱鏡科研繪圖工具更新日志

      1：優(yōu)化了性能

      2：解決bug問題我們是認(rèn)真的